Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms