Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms