Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Erc1Q99MI1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erc1Q99MI1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erc1Q99MI1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Erc1Q99MI1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Erc1Q99MI1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms