Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp1b1Q99LU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms