Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm3Q99LJ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm3Q99LJ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms