Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufsp2Q99K23 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufsp2Q99K23 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms