Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms