Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc4Q924T3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms