Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim7Q923T7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim7Q923T7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms