Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms