Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cts3Q91ZD5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms