Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx4Q91YJ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx4Q91YJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms