Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep1Q91W92 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep1Q91W92 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep1Q91W92 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms