Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd3Q91W18 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms