Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxapQ8VCG9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxapQ8VCG9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms