Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms