Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CipcQ8R0W1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CipcQ8R0W1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms