Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abca5Q8K448 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca5Q8K448 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms