Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssh3Q8K330 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms