Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms