Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms