Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms