Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tshz3Q8CGV9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tshz3Q8CGV9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms