Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms