Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc34Q8CFI2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc34Q8CFI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Cdc34Q8CFI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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