Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup88Q8CEC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms