Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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