Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4aQ8C9S8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms