Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6C7

Fam204a, Protein FAM204A, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam204aQ8C6C7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam204aQ8C6C7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Fam204aQ8C6C7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Fam204aQ8C6C7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam204aQ8C6C7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms