Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms