Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4X7

UPF0258 protein KIAA1024-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C4X7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C4X7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C4X7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms