Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rft1Q8C3B8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rft1Q8C3B8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms