Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms