Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip1Q8C079 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip1Q8C079 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms