Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms