Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp54Q8BL06 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms