Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc2Q8BKV1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc2Q8BKV1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms