Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms