Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Vipas39Q8BGQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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