Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms