Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms