Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Amigo1Q80ZD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amigo1Q80ZD8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms