Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bQ80YF6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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