Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ell3Q80VR2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms