Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms