Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf7ipQ7TT18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf7ipQ7TT18 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms