Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrc2bQ7TPM1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms