Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms