Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssh1Q76I79 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssh1Q76I79 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms