Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms